一种基于10X单细胞转录组测序数据的分析方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201910246518.6
IPC分类号：G16B30/00;G06K9/62
申请日期：
2019-03-28
申请人：
广州基迪奥生物科技有限公司

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著录项信息

专利名称	一种基于10X单细胞转录组测序数据的分析方法
申请号	CN201910246518.6	申请日期	2019-03-28
法律状态	授权	申报国家	中国
公开/公告日	2019-07-05	公开/公告号	CN109979538A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B30/00	IPC分类号	G;1;6;B;3;0;/;0;0;;;G;0;6;K;9;/;6;2查看分类表>
申请人	广州基迪奥生物科技有限公司	申请人地址	广东省广州市广州国际生物岛螺旋三路6号第五层501、502单元变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	广州基迪奥生物科技有限公司	当前权利人	广州基迪奥生物科技有限公司
发明人	夏昊强;周煌凯;高川;张羽;陶勇;罗玥;邢燕;张秋雪
代理机构	广州三环专利商标代理有限公司	代理人	颜希文;宋静娜

摘要

本发明公开了一种基于10X单细胞转录组测序数据的分析方法，包括步骤：S1，测序数据质控和表达量定量；S2，基于10X单细胞转录组测序数据进行单细胞亚群分类；S3，差异表达基因分析：筛选细胞亚群上调表达的基因，采用Seurat的bimod似然比统计检验，分别对不同类细胞群进行基因差异表达分析；S4，差异基因功能分析：根据S3获得的差异表达基因，进行差异表达基因GO功能分析和/或差异表达基因KEGG功能分析；S5，标记基因筛选与分析：包括标记基因筛选、标记基因表达分布、标记基因蛋白网络分析；方法还包括步骤S6，细胞轨迹分析：包括单细胞轨迹的构建、差异表达基因的分析、细胞轨迹分支分析。采用本发明的方法分析10X单细胞转录组测序数据更准确、更丰富。

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该专利没有引用任何外部专利数据！

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