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一种融合多种序列频率信息识别RNA亚细胞定位方法

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN202110286238.5
  • IPC分类号:G16B40/00;G16B15/00
  • 申请日期:
    2021-03-17
  • 申请人:
    天津大学
著录项信息
专利名称一种融合多种序列频率信息识别RNA亚细胞定位方法
申请号CN202110286238.5申请日期2021-03-17
法律状态实质审查申报国家中国
公开/公告日2021-09-07公开/公告号CN113362898A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B40/00IPC分类号G;1;6;B;4;0;/;0;0;;;G;1;6;B;1;5;/;0;0查看分类表>
申请人天津大学申请人地址
天津市南开区卫津路92号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人天津大学当前权利人天津大学
发明人郭菲;王浩;唐继军;丁漪杰
代理机构天津市北洋有限责任专利代理事务所代理人韩帅
摘要
本发明公开了一种融合多种序列频率信息识别RNA亚细胞定位的计算方法,包括如下步骤:步骤(1):通过RNA亚细胞定位数据库提取mRNAs、lncRNAs、miRNA和ssnoRNAs这四个RNA序列数据集;步骤(2):通过序列特征提取方法获取RNA序列的频率信息;步骤(3):通过高斯函数对提取序列特征进行如下计算构建相应的核K;步骤(4):通过多核支持向量机计算每个核的权重β;步骤(5):计算获得融合后的核K*;步骤(6):根据一对其他的计算方法将融合后的核放入支持向量机中构建SVM的集成模型。本发明可以充分挖掘序列的频率信息,对各种RNA亚细胞定位建立了多标签基准数据集;解决RNA亚细胞定位的一个多标签多分类问题。

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