应用于组织样本中染色体开放结合区域定位的ATAC-seq方法

发明专利无效专利

申请号：
CN201711414078.8
IPC分类号：C12Q1/6869;G06F19/22
申请日期：
2017-12-25
申请人：
上海嘉因生物科技有限公司

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著录项信息

专利名称	应用于组织样本中染色体开放结合区域定位的ATAC-seq方法
申请号	CN201711414078.8	申请日期	2017-12-25
法律状态	撤回	申报国家	中国
公开/公告日	2018-05-11	公开/公告号	CN108018345A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	C12Q1/6869 ? IPC结构图谱： C 化学；冶金 C0 化学 C12 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程 C12Q 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（免疫检测入G01N33/53）；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制〔3〕 C12Q1/00 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（带有条件测量或传感器的测定或试验装置，如菌落计数器入C12M1/34）；其组合物；这种组合物的制备方法〔3，2006.01〕 C12Q1/68 包括核酸〔3，2006.01，2018.01〕 C12Q1/6869 测序方法〔2018.01〕	IPC分类号	C;1;2;Q;1;/;6;8;6;9;;;G;0;6;F;1;9;/;2;2查看分类表>
申请人	上海嘉因生物科技有限公司	申请人地址	上海市杨浦区国伟路135号10号楼305室变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	上海嘉因生物科技有限公司	当前权利人	上海嘉因生物科技有限公司
发明人	李旦
代理机构	暂无	代理人	暂无

摘要

本发明涉及应用于组织样本中染色体开放结合区域定位的ATAC‑seq方法，包括细胞悬液制备、转座反应与纯化、去除杂质、PCR扩增、高通量测序、概率检测。该方法采用转座酶法进行DNA片段化，将繁琐的DNA片段化、末端修复和接头连接反应等步骤变为一步简单的酶促反应，缩短实验时间。可以快速的得到调控的多维信息，比其他方法要节省大约3到5个数量级的细胞。实验流程中没有片段选择的步骤，所以这种方法可以同时获得“开放”染色质的位置、转录因子的结合位点、核小体的调控区域和染色质状态等信息。

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