一种计算机预测蛋白功能的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201010567278.9
IPC分类号：G06F19/10
申请日期：
2010-11-30
申请人：
中国科学院大连化学物理研究所

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著录项信息

专利名称	一种计算机预测蛋白功能的方法
申请号	CN201010567278.9	申请日期	2010-11-30
法律状态	授权	申报国家	中国
公开/公告日	2012-05-30	公开/公告号	CN102479295A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/10 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕 G06F19/10 生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统（放映虚拟化学库的虚拟方法入C40B 30/02；创建虚拟化学库的虚拟或数学方法入C40B 50/02）〔2011.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;1;0查看分类表>
申请人	中国科学院大连化学物理研究所	申请人地址	辽宁省大连市中山路457号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中国科学院大连化学物理研究所	当前权利人	中国科学院大连化学物理研究所
发明人	李国辉;徐贝思;张鼎林
代理机构	沈阳科苑专利商标代理有限公司	代理人	李晓光

摘要

本发明涉及一种计算机预测蛋白功能的方法，包括以下步骤：对生物大分子的原子之间的距离进行半粗粒化统计，得到生物大分子之间相互作用的半粗粒化统计势函数；利用半粗粒化统计势函数在目标蛋白周围空间找到相互作用的热点区域；结合分子碎片生长方法，在热点区域寻找可有与目标蛋白紧密结合的蛋白质、DNA或RNA序列片段；计算蛋白质、DNA或RNA序列片段与目标蛋白结合的强度并排序；选取规定数量的序列片段及其结构，在相关的生物功能数据库中进行搜索，查找相应的生物功能，预测到目标蛋白可能具有的功能。本发明具有已有粗粒化统计势函数计算速度快的优点，而且也将与分子碎片生长方法结合的更加紧密、具有目前已有粗粒化统计势所不具备的准确性。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
1	CN101122933A	2008-02-13	2007-09-10	一种利用计算机模拟计算蛋白质与DNA之间作用力的方法失效专利	山东大学
2	CN101794351A	2010-08-04	2010-03-09	一种基于大间隔最近中心点的蛋白质二级结构的工程预测方法失效专利	哈尔滨工业大学
3	CN101082944A	2007-12-05	2007-06-01	基于综合算法的蛋白质折叠过程的计算机模拟方法无效专利	哈尔滨工程大学
4	CN101294970A	2008-10-29	2007-04-25	蛋白质三维结构的预测方法失效专利	中国医学科学院基础医学研究所

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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