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蛋白质三维结构的预测方法

发明专利无效专利
  • 申请号:
    CN200710098715.5
  • IPC分类号:G01N33/543
  • 申请日期:
    2007-04-25
  • 申请人:
    中国医学科学院基础医学研究所
著录项信息
专利名称蛋白质三维结构的预测方法
申请号CN200710098715.5申请日期2007-04-25
法律状态权利终止申报国家中国
公开/公告日2008-10-29公开/公告号CN101294970
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G01N33/543IPC分类号G;0;1;N;3;3;/;5;4;3查看分类表>
申请人中国医学科学院基础医学研究所申请人地址
北京市东单三条5号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人中国医学科学院基础医学研究所当前权利人中国医学科学院基础医学研究所
发明人唐鹤云;张正国;杨啸林;郭亚峰
代理机构北京戈程知识产权代理有限公司代理人程伟
摘要
本发明提供了一种预测蛋白质三维结构的方法。该方法通过1)将要预测三维结构的目标蛋白质序列中的一个氨基酸(例如第一个)设定预测坐标值,2)以1)中的下一个氨基酸(例如第二个)为中央氨基酸在目标序列中分割一个九肽片段,3)在九肽片段数据库中搜索与步骤2)的序列最佳匹配的九肽片段,4)根据搜索出的最佳匹配片段的中央氨基酸的相对坐标计算目标九肽片段中央氨基酸的坐标,将其装配到目标蛋白上,5)以目标序列的下一个氨基酸(例如第三个)作为下一个中央氨基酸重复进行上述的分割、搜索、装配步骤,直至最后一个氨基酸装配结束。该方法获得的目标蛋白质序列结构具有较好的精度,解决了侧链安置问题,运算量小,计算速度快。

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