基于Hilbert编码的增强子-启动子相互作用预测方法及装置

发明专利有效专利

申请号：
CN202110787057.0
IPC分类号：G16B20/30;G06Q10/04;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08
申请日期：
2021-07-13
申请人：
四川大学

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法律信息

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著录项信息

专利名称	基于Hilbert编码的增强子-启动子相互作用预测方法及装置
申请号	CN202110787057.0	申请日期	2021-07-13
法律状态	公开	申报国家	中国
公开/公告日	2021-10-22	公开/公告号	CN113539358A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B20/30	IPC分类号	G;1;6;B;2;0;/;3;0;;;G;0;6;Q;1;0;/;0;4;;;G;0;6;K;9;/;6;2;;;G;0;6;N;3;/;0;4;;;G;0;6;N;3;/;0;8查看分类表>
申请人	四川大学	申请人地址	四川省成都市武侯区一环路南一段24号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	四川大学	当前权利人	四川大学
发明人	朱敏;张铭洋;胡宇佳;王心翌;龙春林;姚林
代理机构	成都禾创知家知识产权代理有限公司	代理人	刘凯

摘要

本发明公开了一种基于Hilbert编码的增强子‑启动子相互作用预测方法及装置，属于生物信息领域。针对现有方法未考虑增强子和启动子空间位置信息的问题，本方法的核心贡献在于提出基于希尔伯特空间曲线的编码方式，它保留增强子序列和启动子序列在三维空间中的位置信息，进而提高模型预测准确率。除此之外，该方法通过迁移学习预训练策略提高模型的泛化能力，学习更多种类特征以提升模型跨细胞系预测精度。最后，在基准数据集上对本发明提出的方法进行评价，在预测精度及模型泛化方面均优于现有技术。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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