基于基因序列的物种快速查找及建库方法、系统和介质

发明专利有效专利

申请号：
CN201911283115.5
IPC分类号：G16B50/30;G06F16/903
申请日期：
2019-12-13
申请人：
人和未来生物科技（长沙）有限公司

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法律信息

引证文献

著录项信息

专利名称	基于基因序列的物种快速查找及建库方法、系统和介质
申请号	CN201911283115.5	申请日期	2019-12-13
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2020-04-24	公开/公告号	CN111063394A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B50/30	IPC分类号	G;1;6;B;5;0;/;3;0;;;G;0;6;F;1;6;/;9;0;3查看分类表>
申请人	人和未来生物科技（长沙）有限公司	申请人地址	湖南省长沙市长沙高新开发区文轩路27号麓谷钰园C2栋1101号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	人和未来生物科技（长沙）有限公司	当前权利人	人和未来生物科技（长沙）有限公司
发明人	马丑贤;李根;王振国;冯博伦;徐霞丽;杨耀;杨仁武;蒋艳凰
代理机构	湖南兆弘专利事务所（普通合伙）	代理人	邹大坚;刘畅舟

摘要

本发明公开了一种基于基因序列的物种快速查找方法，包括以下步骤：1)输入包含待查找的未知物种的特征信息的集合A，所述特征信息包括未知物种的采样基因序列子序列及其反向互补序列中字典序的最小值K*j，i1、采样基因序列子序列在所属基因序列中的起始位置Pj，i1以及判断K*j，i1是否为采样基因序列子序列反向互补序列的逻辑符号Dj，i1；2)将集合A分别与预设的已知物种数据库匹配计算相似性；3)根据相似性最大的匹配结果确定待查找基因序列的物种查找结果。本发明通过设置未知物种的采样基因序列子序列及其反向互补序列中字典序的最小值K*j，i1，将待查询基因序列中反向互补的子序列调整为序列相同，减少了需要匹配的子序列种类，从而在进行查询时提升了效率。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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