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从头测序方法及装置

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN201611019740.5
  • IPC分类号:G01N27/62
  • 申请日期:
    2016-11-14
  • 申请人:
    中国科学院计算技术研究所
著录项信息
专利名称从头测序方法及装置
申请号CN201611019740.5申请日期2016-11-14
法律状态授权申报国家中国
公开/公告日2017-05-31公开/公告号CN106770605A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G01N27/62IPC分类号G;0;1;N;2;7;/;6;2查看分类表>
申请人中国科学院计算技术研究所申请人地址
北京市海淀区中关村科学院南路6号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人中国科学院计算技术研究所当前权利人中国科学院计算技术研究所
发明人杨皓;迟浩;周文婧;何昆;曾文锋;刘超;孙瑞祥;贺思敏
代理机构北京泛华伟业知识产权代理有限公司代理人王勇;苏晓丽
摘要
本发明提供了从头测序方法,其包括将待解析的谱图转化为质谱连接图,统计所述质谱连接图中各条路径的得分,提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段,其中,所述普通路径为仅由普通边组的路径,所述修改路径为由普通边和修饰边组成的路径且其中仅包含一条修饰边;以及对于每个候选肽段进行肽谱匹配打分,取肽谱匹配打分最高的候选肽段作为所述谱图对应的肽段。该方法可以支持上千种意外修饰的发现,而且不会对肽段鉴定的速度有较大影响。另外,还可以更细粒度地区分相似肽段序列,改善了肽段鉴定的准确率。

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