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用于高精度识别变体的系统和方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201680054282.0
IPC分类号：G06F19/22;G06F19/26;G06F19/28
申请日期：
2016-08-25
申请人：
南托米克斯有限责任公司

基础信息

权利要求

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法律信息

引证文献

著录项信息

专利名称	用于高精度识别变体的系统和方法
申请号	CN201680054282.0	申请日期	2016-08-25
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2018-07-31	公开/公告号	CN108351917A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/22 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕 G06F19/10 生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统（放映虚拟化学库的虚拟方法入C40B 30/02；创建虚拟化学库的虚拟或数学方法入C40B 50/02）〔2011.01〕 G06F19/22 用于序列比较核苷酸或者氨基酸的，例如：同族检索，模序或SNP〔单个核苷酸的多态现象〕发现或序列排列〔2011.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;2;2;;;G;0;6;F;1;9;/;2;6;;;G;0;6;F;1;9;/;2;8查看分类表>
申请人	南托米克斯有限责任公司	申请人地址	美国加利福尼亚州变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	南托米克斯有限责任公司	当前权利人	南托米克斯有限责任公司
发明人	J·Z·桑伯恩
代理机构	北京市中伦律师事务所	代理人	杨黎峰;钟锦舜

摘要

提出了用于计算机模拟预测患者的HLA分型的系统和方法，其中，在德布鲁因图中使用患者序列读段和具有已知且不同的HLA等位基因的参考序列。然后使用复合匹配分数对HLA等位基因进行排序，从而提供第一HLA分型。通过使用经调整的复合匹配分数重新排序而鉴定第二HLA分型。

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