一种基于三代PacBio和Hi-C技术组装和注释湖羊基因组的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202110409764.6
IPC分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06
申请日期：
2021-04-16
申请人：
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

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著录项信息

专利名称	一种基于三代PacBio和Hi-C技术组装和注释湖羊基因组的方法
申请号	CN202110409764.6	申请日期	2021-04-16
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2021-07-16	公开/公告号	CN113122642A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	C12Q1/6888 ? IPC结构图谱： C 化学；冶金 C0 化学 C12 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程 C12Q 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（免疫检测入G01N33/53）；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制〔3〕 C12Q1/00 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（带有条件测量或传感器的测定或试验装置，如菌落计数器入C12M1/34）；其组合物；这种组合物的制备方法〔3，2006.01〕 C12Q1/68 包括核酸〔3，2006.01，2018.01〕 C12Q1/6876 用于核酸分析的核酸产品，如引物或探针〔2018.01〕 C12Q1/6888 用于生物体的检测与识别〔2018.01〕	IPC分类号	C;1;2;Q;1;/;6;8;8;8;;;C;1;2;Q;1;/;6;8;0;6;;;C;1;2;Q;1;/;6;8;6;9;;;C;4;0;B;5;0;/;0;6查看分类表>
申请人	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	申请人地址	甘肃省兰州市七里河区硷沟沿335号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所	当前权利人	中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
发明人	卢曾奎;刘建斌;袁超;杨博辉;岳耀敬;郭婷婷;牛春娥;李建烨
代理机构	北京力量专利代理事务所（特殊普通合伙）	代理人	戴治娟

摘要

本发明属于生物信息技术领域，具体涉及一种基于三代PacBio和Hi‑C技术组装和注释湖羊基因组的方法，所述的方法包括如下步骤：(1)采集湖羊基因组片段；(2)构建基因组文库和转录组文库；(3)基因组大小和杂合率评估；(4)基因组组装、纠错和评估；(5)Hi‑C辅助组装、评估和纠错；(6)基因组注释和评估。本发明组装了湖羊染色体级别的高质量基因组，这不仅为湖羊种群遗传资源保护与利用研究提供了宝贵的基因组资源，而且为进一步研究湖羊特有畜禽品种的环境适应机制奠定了坚实的基础。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
该专利没有引用任何外部专利数据！

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