一种蛋白质鉴定方法及系统

发明专利有效专利

申请号：
CN201711113675.7
IPC分类号：G01N27/62
申请日期：
2017-11-13
申请人：
复旦大学

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法律信息

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著录项信息

专利名称	一种蛋白质鉴定方法及系统
申请号	CN201711113675.7	申请日期	2017-11-13
法律状态	授权	申报国家	中国
公开/公告日	2018-02-23	公开/公告号	CN107727727A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G01N27/62 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G01 测量；测试 G01N （除免疫测定法以外包括酶或微生物的测量或试验入C12M，C12Q） G01N27/00 用电、电化学或磁的方法测试或分析材料（G01N 3/00至G01N 25/00优先；电或磁变量的测量或试验，材料的电磁性能的测试或试验入G01R） G01N27/62 通过测试气体的电离，通过测试放电，例如阴极发射	IPC分类号	G;0;1;N;2;7;/;6;2查看分类表>
申请人	复旦大学	申请人地址	上海市杨浦区邯郸路220号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	复旦大学	当前权利人	复旦大学
发明人	尹文波;王伶俐;仇进;康萍
代理机构	上海正旦专利代理有限公司	代理人	陆飞;陆尤

摘要

本发明属于生物分析技术领域，具体为一种蛋白质鉴定方法及系统。本发明方法包括：根据蛋白酶对待测蛋白质进行酶切操作，利用蛋白质串联质谱技术获得待测蛋白质的二级质谱；对蛋白质数据库中的蛋白质序列进行虚拟酶切操作，提取符合要求的第一类肽段；利用FPGA加速算法根据第一类肽段生成理论谱；利用FPGA加速模块将待测蛋白质的二级质谱与理论谱对比，进行相似性打分；将得分结果最高的理论谱对应的肽段序列确定为蛋白质的肽段序列；依次确定蛋白质的所有肽段序列，得到蛋白质序列。采用本发明所提供的蛋白质鉴定方法及系统，实现了在FPGA上加速，整个打分过程加速约为25倍左右，加速效果良好，提高了系统的运行效率。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
该专利没有引用任何外部专利数据！

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