一种基于NGS的CNV分析检测脑胶质瘤染色体的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202110563064.2
IPC分类号：C12Q1/6858
申请日期：
2021-05-24
申请人：
阔然生物医药科技（上海）有限公司

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著录项信息

专利名称	一种基于NGS的CNV分析检测脑胶质瘤染色体的方法
申请号	CN202110563064.2	申请日期	2021-05-24
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2021-09-07	公开/公告号	CN113355401A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	C12Q1/6858 ? IPC结构图谱： C 化学；冶金 C0 化学 C12 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程 C12Q 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（免疫检测入G01N33/53）；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制〔3〕 C12Q1/00 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（带有条件测量或传感器的测定或试验装置，如菌落计数器入C12M1/34）；其组合物；这种组合物的制备方法〔3，2006.01〕 C12Q1/68 包括核酸〔3，2006.01，2018.01〕 C12Q1/6844 核酸扩增反应〔2018.01〕 C12Q1/6858 等位基因特异性扩增〔2018.01〕	IPC分类号	C;1;2;Q;1;/;6;8;5;8查看分类表>
申请人	阔然生物医药科技（上海）有限公司	申请人地址	上海市嘉定区安亭镇宝安公路4997号1幢2层A区201室变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	阔然生物医药科技（上海）有限公司	当前权利人	阔然生物医药科技（上海）有限公司
发明人	李唐建
代理机构	暂无	代理人	暂无

摘要

本发明公开了一种基于NGS的CNV分析检测脑胶质瘤染色体的方法，优化适合于脑胶质瘤检测的WES探针设计，尤其是优化了7号和10号染色体的探针设计，保证高捕获率，高覆盖率；通过DNA提取试剂盒提取肿瘤样本的DNA，然后使用Illumina建库试剂盒建库；通过Illumina测序仪测序,下机的fastq数据经过Trimmomatic处理，主要对接头序列和低质量序列进行过滤；本发明基于NGS的全外显子组测序的拷贝数变异分析技术检测脑胶质瘤第7号染色体获得和第10号染色体缺失（+7/‑10）使得能利用二代测序一次性对胶质瘤IDH、+7/‑10、TERT、EGFR、ATRX和TP53等分子标志物进行检测，降低了时间成本和费用，降低了检测对DNA样本的要求、提高检测的灵敏度。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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