一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201711287578.X
IPC分类号：C12Q1/6869
申请日期：
2017-12-07
申请人：
中国科学院生态环境研究中心

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专利名称	一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法
申请号	CN201711287578.X	申请日期	2017-12-07
法律状态	暂无	申报国家	暂无
公开/公告日	2018-05-22	公开/公告号	CN108060219A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	C12Q1/6869 ? IPC结构图谱： C 化学；冶金 C0 化学 C12 生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程 C12Q 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（免疫检测入G01N33/53）；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制〔3〕 C12Q1/00 包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法（带有条件测量或传感器的测定或试验装置，如菌落计数器入C12M1/34）；其组合物；这种组合物的制备方法〔3，2006.01〕 C12Q1/68 包括核酸〔3，2006.01，2018.01〕 C12Q1/6869 测序方法〔2018.01〕	IPC分类号	C;1;2;Q;1;/;6;8;6;9查看分类表>
申请人	中国科学院生态环境研究中心	申请人地址	北京市海淀区双清路18号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中国科学院生态环境研究中心	当前权利人	中国科学院生态环境研究中心
发明人	邓晔;宋茂勇;厉舒祯
代理机构	北京风雅颂专利代理有限公司	代理人	张拥

摘要

本发明公开了一种利用碳基纳米材料提升细菌群落多样性检测准确性的方法，包括以下步骤：(1)采集细菌群落样本，提取细菌群落样本的16SrRNA基因，并根据细菌群落样本的16SrRNA基因设计并合成上下游引物；(2)将碳基纳米材料与PCR扩增反应体系混合均匀，并利用上下游引物扩增细菌群落样本的16SrRNA基因；(3)PCR产物分离纯化后，构建文库后进行高通量测序，对测序数据进行处理后，分析嵌合体数量并去除嵌合体序列，然后对非嵌合体序列进行比对，确定错配序列的数量。本发明的碳基纳米材料能够减少细菌群落多样性检测过程嵌合体及错配碱基的产生，从而提升细菌群落多样性检测的准确性。

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