一种基于模块化识别的基因网络推理方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202110309281.9
IPC分类号：G16B5/00;G16B40/00
申请日期：
2021-03-23
申请人：
浙江大学

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法律信息

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著录项信息

专利名称	一种基于模块化识别的基因网络推理方法
申请号	CN202110309281.9	申请日期	2021-03-23
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2021-07-02	公开/公告号	CN113066522A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B5/00	IPC分类号	G;1;6;B;5;/;0;0;;;G;1;6;B;4;0;/;0;0查看分类表>
申请人	浙江大学	申请人地址	浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	浙江大学	当前权利人	浙江大学
发明人	张蔚;李心语;张建明;李光
代理机构	杭州求是专利事务所有限公司	代理人	刘静

摘要

本发明公开了一种基于模块化识别的基因网络推理方法。该方法将n个基因的表达信息作为训练集，其中每个基因有m个样本；采用ICA‑FDR算法对基因进行模块识别并将n个基因划分至不同基因模块中；基因模块内部的调控关系采用以梯度提升树为基础的算法进行推理，基因模块间的调控关系采用以稀疏回归为基础的算法进行推理，得出每个基因对的相关性得分；针对每个基因模块内与模块间推理得到的相关性得分分别进行归一化处理后合并，并按照得分降序排序得到最终基因调控网络。本发明为基因模块识别与基因网络推理提供了一个无缝衔接的融合框架，提高了基因模块识别的准确性，增加了基因调控网络功能的可解释性。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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