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基于特征的基因组序列数据库的搜索方法

发明专利无效专利
  • 申请号:
    CN200410041883.7
  • IPC分类号:--
  • 申请日期:
    2004-09-07
  • 申请人:
    东南大学
著录项信息
专利名称基于特征的基因组序列数据库的搜索方法
申请号CN200410041883.7申请日期2004-09-07
法律状态驳回申报国家中国
公开/公告日2005-03-23公开/公告号CN1598821
优先权暂无优先权号暂无
主分类号暂无IPC分类号暂无查看分类表>
申请人东南大学申请人地址
江苏省南京市四牌楼2号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人东南大学当前权利人东南大学
发明人孙啸;焦典
代理机构南京经纬专利商标代理有限公司代理人叶连生
摘要
基于特征的基因组序列数据库的搜索方法,是一种根据序列的统计特征在数据库范围内搜索近似序列的方法搜索方法为:根据序列统计特征间的距离来搜索相似序列,即把不同物种的基因组序列数据的基本信息——即序列在基因库的数据库登录号、序列所属的物种名称、序列所在该物种的染色体号和序列原始数据、以及从统计学角度体现序列特征的包括碱基组成特性、碱基对相关性统计特征值存储到数据库里;对于客户提交的任何一个基因片段,首先根据客户的要求计算它的一个特征值,再依次计算该序列的特征值与数据库内所有序列的相应特征值之间的距离,比较相似序列;按照距离由小到大,排列显示出数据库里和用户提交的序列最相似的一部分序列。

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