一种残基对距离约束引导的片段组装方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202110441230.1
IPC分类号：G16B15/20;G16B45/00
申请日期：
2021-04-23
申请人：
浙江工业大学

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著录项信息

专利名称	一种残基对距离约束引导的片段组装方法
申请号	CN202110441230.1	申请日期	2021-04-23
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2021-08-13	公开/公告号	CN113257339A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B15/20	IPC分类号	G;1;6;B;1;5;/;2;0;;;G;1;6;B;4;5;/;0;0查看分类表>
申请人	浙江工业大学	申请人地址	浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	浙江工业大学	当前权利人	浙江工业大学
发明人	张贵军;冯琼琼;刘俊;杨涛;余众泽;郭赛赛;周晓根
代理机构	杭州斯可睿专利事务所有限公司	代理人	王利强

摘要

一种残基对距离约束引导的片段组装方法，首先对预测的残基对距离分布图进行处理，过滤残基对间隔小于3个残基的残基对，根据过滤后的残基对距离分布构建全局构象评估函数。然后采用高斯拟合将过滤后的残基对距离分布按片段插入位置拟合成对应的高斯拟合曲线，接着根据每个位置的高斯拟合曲线对该位置的9片段库文件进行处理得到候选高概率片段，利用高概率片段进行片段组装，提高搜索构象空间的效率，最后利用蛋白质结构聚类算法SPICKER得到最终预测结构。本发明提供一种采样效率较高的残基对距离约束的片段组装方法。

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