使用基于树的空间数据结构对基因数据集的群体分类

发明专利有效专利

申请号：
CN201380041817.7
IPC分类号：G06F19/24;G06F17/30;G06F19/28
申请日期：
2013-08-07
申请人：
皇家飞利浦有限公司

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著录项信息

专利名称	使用基于树的空间数据结构对基因数据集的群体分类
申请号	CN201380041817.7	申请日期	2013-08-07
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2015-04-22	公开/公告号	CN104541276A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/24 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕 G06F19/10 生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统（放映虚拟化学库的虚拟方法入C40B 30/02；创建虚拟化学库的虚拟或数学方法入C40B 50/02）〔2011.01〕 G06F19/24 用于机器学习，数据挖掘或生物统计学的，例如：模式定位，知识发现，规则抽取，相关性，聚类或分类〔2011.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;2;4;;;G;0;6;F;1;7;/;3;0;;;G;0;6;F;1;9;/;2;8查看分类表>
申请人	皇家飞利浦有限公司	申请人地址	荷兰艾恩德霍芬变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	皇家飞利浦有限公司	当前权利人	皇家飞利浦有限公司
发明人	B·查克拉巴蒂;P·穆尼亚帕;S·库马尔;R·辛格;A·马特胡尔
代理机构	永新专利商标代理有限公司	代理人	李光颖;王英

摘要

构建表示参考群体的参考基因数据集的参考特征向量。使用线性变换来对所述参考特征向量进行变换以生成所述参考群体的所述参考基因数据集的降低的维度的向量表示。构建基于树的空间数据结构以将所述参考基因数据集索引为数据点，所述数据点由所述参考群体的所述参考基因数据集的所述降低的维度的向量表示的至少一些维定义。可以通过对所述参考特征向量执行特征约简来生成所述线性变换。使用所述线性变换对表示先证者基因数据集的特征向量进行变换以生成降低的维度的向量表示，所述降低的维度的向量表示被定位在所述基于树的空间数据结构中以执行针对所述先证者基因数据集的群体分配。

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