一种用于基因比对的加速方法、装置、存储介质与服务器

发明专利有效专利

申请号：
CN202010442856.X
IPC分类号：G16B50/00;G16B50/50;G16B30/10
申请日期：
2020-05-22
申请人：
北京哲源科技有限责任公司

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法律信息

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著录项信息

专利名称	一种用于基因比对的加速方法、装置、存储介质与服务器
申请号	CN202010442856.X	申请日期	2020-05-22
法律状态	实质审查	申报国家	暂无
公开/公告日	2020-09-11	公开/公告号	CN111653318A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B50/00	IPC分类号	G;1;6;B;5;0;/;0;0;;;G;1;6;B;5;0;/;5;0;;;G;1;6;B;3;0;/;1;0查看分类表>
申请人	北京哲源科技有限责任公司	申请人地址	北京市海淀区中关村南一条乙3号中国科学报社314室变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	北京哲源科技有限责任公司	当前权利人	北京哲源科技有限责任公司
发明人	谭光明;王元戎;张中海
代理机构	北京律诚同业知识产权代理有限公司	代理人	祁建国

摘要

本发明提出一种用于基因比对的加速方法，其特征在于，包括：步骤1，获取待比对的基因序列，并将该基因序列中的各碱基存储于一压缩式BWT数据结构，得到一BWT序列，于该BWT序列中插入一计数点，得到一压缩序列；步骤2，获取一目标碱基，将该压缩序列中的该计数点以表项的形式存储于一查找表中，通过访存该查找表中的该计数点，对该压缩序列中的每一个碱基与所述目标碱基进行比对，得到比对结果；其中，所述压缩式BWT数据结构采用二进制位存储所述基因序列中的各碱基。

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