一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202010060429.5
IPC分类号：G16B30/00;G16B40/00;G06K9/62
申请日期：
2020-01-19
申请人：
西安理工大学

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专利名称	一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法
申请号	CN202010060429.5	申请日期	2020-01-19
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2020-06-12	公开/公告号	CN111276188A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B30/00	IPC分类号	G;1;6;B;3;0;/;0;0;;;G;1;6;B;4;0;/;0;0;;;G;0;6;K;9;/;6;2查看分类表>
申请人	西安理工大学	申请人地址	陕西省西安市金花南路5号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	西安理工大学	当前权利人	西安理工大学
发明人	李爱民;刘雅君;裴广胜;刘光明;费蓉;周红芳;王磊;黑新宏
代理机构	北京国昊天诚知识产权代理有限公司	代理人	杨洲

摘要

一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法，包括以下步骤：步骤1，计算角度特征；步骤2，用AffinityPropagation聚类算法聚类；步骤3，获得功能显著的类；把基因表达变化趋势相似的基因聚为一类，同属于一类的基因有功能相似的趋势；对于每一个基因，相邻时间点的基因表达的变化可以计算出角度特征，反映基因表达的局部变化趋势；对于每个时间点，用换算后的角度间接反映整体的表达水平情况；以这些角度为特征，皮尔森相关系数作为相似性测度，相关系数越大，表示两个基因的表达谱越相似；然后用AffinityPropagation聚类算法聚类；具有聚类结果更能反映基因功能、聚类结果做功能富集分析的p值更小的特点。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
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