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一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法及装置

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN201910142574.5
  • IPC分类号:G16B20/00;G16B40/00
  • 申请日期:
    2019-02-26
  • 申请人:
    北京深度制耀科技有限公司
著录项信息
专利名称一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法及装置
申请号CN201910142574.5申请日期2019-02-26
法律状态授权申报国家中国
公开/公告日2019-05-24公开/公告号CN109801676A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B20/00IPC分类号G;1;6;B;2;0;/;0;0;;;G;1;6;B;4;0;/;0;0查看分类表>
申请人北京深度制耀科技有限公司申请人地址
北京市大兴区北京经济技术开发区科创十三街18号院5号楼16层1601室 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人北京深度制耀科技有限公司当前权利人北京深度制耀科技有限公司
发明人戴蝉;李瑛颖;管峥
代理机构北京集佳知识产权代理有限公司代理人暂无
摘要
本申请公开了一种用于评价化合物对基因通路活化作用的方法,包括获取对照组的转录组数据和化合物研究组的转录组数据;根据对照组的转录组数据和化合物研究组的转录组数据,确定转录差异表达倍数数据;对相关基因做聚类处理,将共表达的基因聚类到同一组,获得多个基因共表达单元;获取基因通路,根据基因在基因通路中所起的促进作用、抑制作用、磷酸化作用和去磷酸化作用,相应地为基因通路中的各个基因分配其对应的权重系数,进而确定基因通路拓扑系数矩阵;根据转录差异表达倍数、基因共表达单元以及基因通路拓扑系数矩阵,确定用于评价化合物对于基因通路的活化作用的打分结果。

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