一种用于裂解性多糖单加氧酶(LPMO)分析和鉴定的方法

发明专利有效专利

申请号：
CN202010136315.4
IPC分类号：G16C20/20;G16C20/70;G16C20/90
申请日期：
2020-03-02
申请人：
罗朝兵

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著录项信息

专利名称	一种用于裂解性多糖单加氧酶(LPMO)分析和鉴定的方法
申请号	CN202010136315.4	申请日期	2020-03-02
法律状态	公开	申报国家	中国
公开/公告日	2021-09-07	公开/公告号	CN113362908A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16C20/20	IPC分类号	G;1;6;C;2;0;/;2;0;;;G;1;6;C;2;0;/;7;0;;;G;1;6;C;2;0;/;9;0查看分类表>
申请人	罗朝兵	申请人地址	四川省乐山市马边彝族自治县劳动乡龙村2组51号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	罗朝兵	当前权利人	罗朝兵
发明人	罗朝兵
代理机构	暂无	代理人	暂无

摘要

本发明公开了的属于分子生物学、基因组学等研究领域，尤其是一种用于裂解性多糖单加氧酶(LPMO)分析和鉴定的方法，LPMO分析通过CAZy数据库提取出来属于后生动物门(Metazoa)并且被实验验证过的LPMO序列，然后将上述序列与CAZy数据库中的所有动物LPMO候选序列进行比对并过滤，最后用muscle进行多序列比对，并用MEGA提取多序列比对中的保守区域后用于构建隐马尔可夫模型，然后采用hmmbuild构建隐马尔可夫模型，使用meme软件生成多序列比对文件的logo图，能使使用者减少时间和成本，鉴定LPMO采用hmmsearch，基于metazoa.LPMO.hmm模型鉴定昆虫纲(Insecta)各个物种的CAZy酶中的LPMO酶，最后进行比对，分析结果一目了然，不用再花多于时间进行结果分析，极大化的提高了工作效率。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
该专利没有引用任何外部专利数据！

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