一种基于大树构建子树的系统进化树重建方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201410806842.6
IPC分类号：G06F19/14
申请日期：
2014-12-22
申请人：
中国科学院计算机网络信息中心

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专利名称	一种基于大树构建子树的系统进化树重建方法
申请号	CN201410806842.6	申请日期	2014-12-22
法律状态	授权	申报国家	中国
公开/公告日	2015-04-29	公开/公告号	CN104573405A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/14 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕 G06F19/10 生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统（放映虚拟化学库的虚拟方法入C40B 30/02；创建虚拟化学库的虚拟或数学方法入C40B 50/02）〔2011.01〕 G06F19/14 用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构〔2011.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;1;4查看分类表>
申请人	中国科学院计算机网络信息中心	申请人地址	北京市海淀区中关村南四街4号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中国科学院计算机网络信息中心	当前权利人	中国科学院计算机网络信息中心
发明人	孟珍;黎建辉;周园春;王学志
代理机构	北京君尚知识产权代理事务所（普通合伙）	代理人	司立彬

摘要

本发明公开了一种基于大树构建子树的系统进化树重建方法。本方法为：1)对系统进化基础大树进行分割，并记录分割次数、分割权值以及每个叶子节点的关系链，然后存储到数据库中；2)根据物种子名录中的物种名称确定一物种子名录列表，从数据库中查找匹配的节点元素列表，并建立该子名录列表与该节点元素列表的映射关系；3)从数据库中检索该节点元素列表中每个节点元素的关系链和节点权值；4)将关系链两两之间进行比对，形成节点元素的分组关系；5)根据节点元素的节点权值和分组关系，计算每个节点元素在系统进化子树中对应的权值；生成并输出该物种子名录对应的系统进行子树。本方法能满足根据名录快速构建生物样方中生物进化关系等需要。

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