一种基于Rosetta局部增强的群体蛋白质结构预测方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201611176255.9
IPC分类号：G16B15/30;G16B20/00
申请日期：
2016-12-19
申请人：
浙江工业大学

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专利名称	一种基于Rosetta局部增强的群体蛋白质结构预测方法
申请号	CN201611176255.9	申请日期	2016-12-19
法律状态	授权	申报国家	中国
公开/公告日	2017-05-31	公开/公告号	CN106778059A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B15/30	IPC分类号	G;1;6;B;1;5;/;3;0;;;G;1;6;B;2;0;/;0;0查看分类表>
申请人	浙江工业大学	申请人地址	浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	浙江工业大学	当前权利人	浙江工业大学
发明人	张贵军;周晓根;郝小虎;王柳静;俞旭锋
代理机构	杭州斯可睿专利事务所有限公司	代理人	王利强

摘要

一种基于Rosetta局部增强的群体蛋白质结构预测方法，首先，将结构预测中的整个算法搜索过程分为四个阶段，对每个阶段设置片段长度进行片段组装，并选用不同的能量函数来衡量构象个体的质量；然后，基于二级结构信息，采用不同的变异策略利用loop区域信息来生成测试构象，并通过随机交换loop区域信息实现交叉过程，保持种群多样性，同时对每个阶段的测试构象和目标构象执行Rosetta局部增强；最后，提取构象的特征向量来衡量各构象个体的多样性，从而以能量函数为主要衡量指标，并以多样性为辅助衡量指标来指导构象种群更新。本发明搜索能力强、能量保持种群多样性、预测精度高。

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