使用三代序列优化二代组装结果的方法和装置

发明专利有效专利

申请号：
CN201710093627.X
IPC分类号：G16B30/10;G16B30/20
申请日期：
2017-02-21
申请人：
深圳华大基因科技服务有限公司

基础信息

权利要求

说明书

PDF全文

法律信息

引证文献

著录项信息

专利名称	使用三代序列优化二代组装结果的方法和装置
申请号	CN201710093627.X	申请日期	2017-02-21
法律状态	授权	申报国家	暂无
公开/公告日	2018-08-28	公开/公告号	CN108460245A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B30/10	IPC分类号	G;1;6;B;3;0;/;1;0;;;G;1;6;B;3;0;/;2;0查看分类表>
申请人	深圳华大基因科技服务有限公司	申请人地址	广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼科技创业园201 变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	深圳华大基因科技服务有限公司	当前权利人	深圳华大基因科技服务有限公司
发明人	贺丽娟;邓天全;刘亚斌;杨林峰;高强
代理机构	深圳鼎合诚知识产权代理有限公司	代理人	暂无

摘要

本发明公开了一种使用三代序列优化二代组装结果的方法和装置。该方法包括获取二代组装结果和三代组装结果；以三代组装结果为参考序列，将二代组装结果比对到参考序列；获取二代组装结果的间隙序列两侧的重叠群序列中比对到参考序列和未比对到参考序列的序列；将未比对到参考序列的序列替换为间隙序列，得到新的间隙序列；对新的间隙序列，使用三代数据进行补洞得到优化后的二代组装结果。本发明能够提高基因组组装指标和拼接的准确性。

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
该专利没有引用任何外部专利数据！

序号	公开(公告)号	公开(公告)日	申请日	专利名称	申请人
该专利没有被任何外部专利所引用！

我浏览过的专利

专利服务由北京酷爱智慧知识产权代理公司提供