一种寻找调控一组相关基因的转录因子的计算方法

发明专利无效专利

申请号：
CN200510075327.6
IPC分类号：G06F19/00
申请日期：
2005-06-16
申请人：
清华大学;中国医学科学院基础医学研究所

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著录项信息

专利名称	一种寻找调控一组相关基因的转录因子的计算方法
申请号	CN200510075327.6	申请日期	2005-06-16
法律状态	撤回	申报国家	中国
公开/公告日	2006-12-20	公开/公告号	CN1881225
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/00 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;0;0查看分类表>
申请人	清华大学;中国医学科学院基础医学研究所	申请人地址	北京市海淀区清华大学人环楼305 变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	清华大学,中国医学科学院基础医学研究所	当前权利人	清华大学,中国医学科学院基础医学研究所
发明人	庄海滨;张凌慧;刘湘军;刘德培;梁植权
代理机构	暂无	代理人	暂无

摘要

本发明属于计算生物学领域，具体涉及一种寻找调控一组相关基因的转录因子的计算方法。通过计算转录因子在一组相关基因中结合位点的实际个数与期望个数的比值，来判定转录因子与这组基因的关系。如果比值高于预先计算的共调控显著性阈值，则认为转录因子与这组基因有关。共调控显著性阈值则是位点权重矩阵算法的特异性、共调控比和总体调控率确定的。该方法大大提高了预测调控相关基因的转录因子的准确性，从生物学特征出发界定相关基因的关系和共调控的比例，涉及参数少且计算方法简单，便于生物学家应用。

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