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一种差异甲基化位点识别方法

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN201710419211.2
  • IPC分类号:G16B20/00;G16B40/00;G16H50/70
  • 申请日期:
    2017-06-06
  • 申请人:
    电子科技大学
著录项信息
专利名称一种差异甲基化位点识别方法
申请号CN201710419211.2申请日期2017-06-06
法律状态授权申报国家中国
公开/公告日2017-10-13公开/公告号CN107247873A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B20/00IPC分类号G;1;6;B;2;0;/;0;0;;;G;1;6;B;4;0;/;0;0;;;G;1;6;H;5;0;/;7;0查看分类表>
申请人电子科技大学申请人地址
四川省成都市高新区(西区)西源大道2006号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人电子科技大学当前权利人电子科技大学
发明人凡时财;宋应;邹见效;何建;徐红兵
代理机构成都行之专利代理事务所(普通合伙)代理人温利平
摘要
本发明公开了一种差异甲基化位点识别方法,通过分类的思想将差异甲基化位点识别转换为一种通过特征选择方法寻找对分类有重要贡献的位点,即差异甲基化位点。具体来说,首先对从公共数据库获取到的450K甲基化芯片数据进行数据预处理,包括标准化数据消除组内误差、去除批次效应消除组间误差、去掉方差较小的位点;其次,通过构建随机森林模型得到每个位点对分类的贡献值;最后,若位点贡献值大于0,则认为该位点为差异甲基化位点。通过这种方法得到的差异甲基化位点能够具有更好的类别判定性能,为癌症诊断提供更精确结果。

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