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比对不同全基因组测序方法的测序结果覆盖率的方法

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN202110673259.2
  • IPC分类号:G16B30/10;G16B50/30
  • 申请日期:
    2021-06-17
  • 申请人:
    南京诺因生物科技有限公司
著录项信息
专利名称比对不同全基因组测序方法的测序结果覆盖率的方法
申请号CN202110673259.2申请日期2021-06-17
法律状态实质审查申报国家中国
公开/公告日2021-08-06公开/公告号CN113223619A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B30/10IPC分类号G;1;6;B;3;0;/;1;0;;;G;1;6;B;5;0;/;3;0查看分类表>
申请人南京诺因生物科技有限公司申请人地址
江苏省南京市江北新区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园一期A座1802-1807 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人南京诺因生物科技有限公司当前权利人南京诺因生物科技有限公司
发明人易康;安泰然
代理机构南京禾易知识产权代理有限公司代理人张松云
摘要
本发明公开了一种比对不同全基因组测序方法的测序结果覆盖率的方法,其步骤包括:读取同一物种不同全基因组的测序结果,创建一个新的fasta文件夹,将fasta文件复制到fasta文件夹中;对fasta文件夹下的fasta文件进行建库;将fasta文件夹下fasta文件序列进行分割;使用blast工具将分割后的片段与第二步建好的数据库进行比对;通过筛选将比对到自身的序列去除;对过滤后的结果进行得分计算,排分最高的就是覆盖率最高的全基因组测序方法得到的测序结果。本发明通过对比结果,可以轻松找出哪个基因组覆盖率更高。

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