蛋白质组过滤进化分类方法及其系统

发明专利无效专利

申请号：
CN201010154839.2
IPC分类号：G06F19/14
申请日期：
2010-04-20
申请人：
中国科学院研究生院

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著录项信息

专利名称	蛋白质组过滤进化分类方法及其系统
申请号	CN201010154839.2	申请日期	2010-04-20
法律状态	权利终止	申报国家	中国
公开/公告日	2010-09-22	公开/公告号	CN101840467A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G06F19/14 ? IPC结构图谱： G 物理 G0 仪器 G06 计算；推算；计数 G06F 电数字数据处理（基于特定计算模型的计算机系统入G06N） G06F19/00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法（专门适用于特定功能的入G06F17/00；专门适用于行政、商业、金融、管理、监督或预测目的的数据处理系统或数据处理方法入G06Q；医疗信息学入G16H）〔6，2006.01，2011.01，2018.01〕 G06F19/10 生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统（放映虚拟化学库的虚拟方法入C40B 30/02；创建虚拟化学库的虚拟或数学方法入C40B 50/02）〔2011.01〕 G06F19/14 用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构〔2011.01〕	IPC分类号	G;0;6;F;1;9;/;1;4查看分类表>
申请人	中国科学院研究生院	申请人地址	北京市石景山区玉泉路甲19号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	中国科学院研究生院	当前权利人	中国科学院研究生院
发明人	王嵬;段红军
代理机构	北京市商泰律师事务所	代理人	麻吉凤;毛燕生

摘要

本发明公开了一种蛋白质组过滤进化分类方法及其系统，所述方法包括：原始数据获取步骤，获取所要进行分类的物种的基因组数据和蛋白质组数据(S110)；预测步骤，基于所述基因组数据，预测基因组序列中的横向转移基因(S120)；过滤步骤，基于蛋白质组数据和横向转移基因，在蛋白质组中过滤掉与横向转移基因对应的蛋白质序列(S130)；计算步骤，用过滤后的蛋白质组序列计算物种间进化距离(S140)；以及推断步骤，利用物种间的进化距离推断物种间的系统发生关系(S150)。根据本发明，可以排除在推断生物系统发生过程时存在的由横向基因转移所引起的干扰信息，从而可以使推断出的生物系统发生过程更加准确，为生物进化分类提供更加可靠的分类依据。

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