一种基于蛋白质的拓扑与功能特征的关键蛋白识别方法

发明专利有效专利

申请号：
CN201910891225.3
IPC分类号：G16B5/00
申请日期：
2019-09-20
申请人：
长沙学院;重庆电子工程职业学院

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专利名称	一种基于蛋白质的拓扑与功能特征的关键蛋白识别方法
申请号	CN201910891225.3	申请日期	2019-09-20
法律状态	实质审查	申报国家	中国
公开/公告日	2020-01-07	公开/公告号	CN110660448A
优先权	暂无	优先权号	暂无
主分类号	G16B5/00	IPC分类号	G;1;6;B;5;/;0;0查看分类表>
申请人	长沙学院;重庆电子工程职业学院	申请人地址	湖南省长沙市开福区洪山路98号变更专利地址、主体等相关变化，请及时变更，防止失效
权利人	长沙学院,重庆电子工程职业学院	当前权利人	长沙学院,重庆电子工程职业学院
发明人	王雷;邹赛;朱贤友;陈治平
代理机构	重庆蕴博君晟知识产权代理事务所（普通合伙）	代理人	郑勇

摘要

越来越多的研究表明，酿酒酵母中已发现了大量的蛋白‑蛋白相互作用(PPI)数据，对酵母关键蛋白质识别具有重大意义。到目前为止，已经有一系列从PPI网络预测关键蛋白质的计算方法。然而，这些计算方法的预测精度不能令人十分满意。本发明通过对蛋白基因表达数据进行皮尔逊相关系数(PCC)处理，将原始的PPI网络首先转化为加权的PPI网络。然后，根据加权PPI网络和同源蛋白的信息，提取加权PPI网络中每个蛋白的一些关键网络拓扑特征和蛋白功能特征。根据这些新提取的蛋白质拓扑特征和功能特征，构建一种迭代方法用于基本蛋白质的预测。本发明通过整合蛋白质的功能和网络拓扑特性，有效提高基本蛋白质的预测精度，显著优于现有预测方法的预测精度。

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