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一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法

发明专利有效专利
  • 申请号:
    CN201810579186.9
  • IPC分类号:G16B15/00
  • 申请日期:
    2018-06-07
  • 申请人:
    浙江工业大学
著录项信息
专利名称一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法
申请号CN201810579186.9申请日期2018-06-07
法律状态授权申报国家中国
公开/公告日2018-11-20公开/公告号CN108846256A
优先权暂无优先权号暂无
主分类号G16B15/00IPC分类号G;1;6;B;1;5;/;0;0查看分类表>
申请人浙江工业大学申请人地址
浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号 变更 专利地址、主体等相关变化,请及时变更,防止失效
权利人浙江工业大学当前权利人浙江工业大学
发明人张贵军;彭春祥;刘俊;周晓根;王柳静;胡俊
代理机构杭州斯可睿专利事务所有限公司代理人王利强
摘要
一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法,在进化算法框架下,首先,通过交换构象中的片段生成测试构象;其次,根据序列信息预测目标蛋白的残基接触信息,并设计残基接触能量函数对构象进行打分,通过残基接触能量来指导构象的选择过程,即如果测试构象的能量小于目标构象的能量,则直接接受测试构象,否则进一步比较残基接触能量,若测试构象的残基接触能量较小,则接受,否则以玻尔兹曼概率接受,从而引导算法采样得到能量更低且结构更合理的构象。通过残基接触能量为辅来指导构象选择,从而缓解能量函数不精确导致的预测误差问题。本发明提供一种预测精度较高的基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法。

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