一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法

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一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法

发明专利有效专利
  • 申请号:CN201810579186.9
  • 申请人:浙江工业大学
  • 申请日:2018-06-07
  • 主分类号:G16B15/00
  • 公开(公告)日:2018-11-20
  • 公开/公告号:CN108846256A
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摘要:一种基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法,在进化算法框架下,首先,通过交换构象中的片段生成测试构象;其次,根据序列信息预测目标蛋白的残基接触信息,并设计残基接触能量函数对构象进行打分,通过残基接触能量来指导构象的选择过程,即如果测试构象的能量小于目标构象的能量,则直接接受测试构象,否则进一步比较残基接触能量,若测试构象的残基接触能量较小,则接受,否则以玻尔兹曼概率接受,从而引导算法采样得到能量更低且结构更合理的构象。通过残基接触能量为辅来指导构象选择,从而缓解能量函数不精确导致的预测误差问题。本发明提供一种预测精度较高的基于残基接触信息的群体蛋白质结构预测方法。

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